COPASI

COPASI使科学家能够通过灵活的模拟方法探索生物系统的动态特性。用户可以选择确定性ODE求解器来模拟可预测的大规模动态，或使用随机Gillespie方法来建模固有噪声和离散事件。该应用支持SBML文件，确保模型具有可移植性，并能与广泛的数据库和工具兼容。除了模拟功能外，COPASI还协助完成优化和敏感性分析等任务，为定量系统生物学提供了一个完整且易于使用的独立工具套件。